Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRRTQ9BXP5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRRTQ9BXP5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms