Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC94Q9BW85 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC94Q9BW85 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms