Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHCHD7Q9BUK0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CHCHD7Q9BUK0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms