Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NDC1Q9BTX1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms