Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NICN1Q9BSH3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NICN1Q9BSH3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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