Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT8

CBWD1, COBW domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBWD1Q9BRT8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CBWD1Q9BRT8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CBWD1Q9BRT8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms