Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TXNDC17Q9BRA2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TXNDC17Q9BRA2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms