Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TREX2Q9BQ50 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TREX2Q9BQ50 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms