Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DDX50Q9BQ39 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DDX50Q9BQ39 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms