Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CITED1Q99966 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms