Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DUSP9Q99956 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DUSP9Q99956 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms