Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARID3AQ99856 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARID3AQ99856 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms