Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5SQ99766 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms