Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPS6KC1Q96S38 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms