Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
PHF12Q96QT6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PHF12Q96QT6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms