Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAB3IPQ96QF0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAB3IPQ96QF0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms