Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ALS2Q96Q42 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
ALS2Q96Q42 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms