Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SYNGAP1Q96PV0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms