Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GPR78Q96P69 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GPR78Q96P69 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms