Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
COG8Q96MW5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
COG8Q96MW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms