Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RIPOR3Q96MK2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RIPOR3Q96MK2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms