Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FAM227BQ96M60 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM227BQ96M60 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms