Protein–RNA interactions for Protein: Q96KC9

CABS1, Calcium-binding and spermatid-specific protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABS1Q96KC9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CABS1Q96KC9 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CABS1Q96KC9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms