Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PGBD1Q96JS3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PGBD1Q96JS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms