Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MS4A4AQ96JQ5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MS4A4AQ96JQ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms