Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDHR1Q96JP9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CDHR1Q96JP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms