Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SGSM3Q96HU1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SGSM3Q96HU1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms