Protein–RNA interactions for Protein: Q96FZ7

CHMP6, Charged multivesicular body protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP6Q96FZ7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHMP6Q96FZ7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CHMP6Q96FZ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms