Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG4CQ96DT6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG4CQ96DT6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms