Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FAF2Q96CS3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FAF2Q96CS3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms