Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ULK4Q96C45 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ULK4Q96C45 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.9 ms