Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RFT1Q96AA3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
RFT1Q96AA3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms