Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLAMF9Q96A28 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SLAMF9Q96A28 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms