Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF34Q969K3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF34Q969K3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms