Protein–RNA interactions for Protein: Q92995

USP13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13Q92995 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP13Q92995 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP13Q92995 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP13Q92995 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP13Q92995 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP13Q92995 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP13Q92995 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP13Q92995 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
USP13Q92995 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
USP13Q92995 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
USP13Q92995 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
USP13Q92995 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms