Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TNPO1Q92973 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TNPO1Q92973 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms