Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CSRNP3Q8WYN3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CSRNP3Q8WYN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CSRNP3Q8WYN3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms