Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GATAD2BQ8WXI9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GATAD2BQ8WXI9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms