Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
APOBEC4Q8WW27 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
APOBEC4Q8WW27 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms