Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TSKUQ8WUA8 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TSKUQ8WUA8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms