Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM71BQ8TC56 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM71BQ8TC56 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms