Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CARMIL3Q8ND23 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CARMIL3Q8ND23 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms