Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRPF38AQ8NAV1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRPF38AQ8NAV1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms