Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MFSD2AQ8NA29 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MFSD2AQ8NA29 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.9 ms