Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71DQ8N9W8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71DQ8N9W8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71DQ8N9W8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms