Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SFRP1Q8N474 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SFRP1Q8N474 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms