Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CLIP4Q8N3C7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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CLIP4Q8N3C7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CLIP4Q8N3C7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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CLIP4Q8N3C7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CLIP4Q8N3C7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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