Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HACE1Q8IYU2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HACE1Q8IYU2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms