Protein–RNA interactions for Protein: Q8IY31

IFT20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20Q8IY31 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IFT20Q8IY31 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFT20Q8IY31 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms