Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLF2Q8IX21 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLF2Q8IX21 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms